知网查重只能查两次的原因主要是出于版权保护和服务质量考虑。首先，知网作为一个学术资源平台，为了保护原创作品的版权，限制了查重次数，避免被恶意抄袭。其次，限制查重次数也有利于提高服务质量，确保每次查重都能够得到准确、及时的结果。此外，限制查重次数也可以节约系统资源，保障平台的稳定运行。因此，虽然知网查重只能查两次可能会给用户带来一定的不便，但从整体考虑，这样的规定是合理的。

除了版权保护和服务质量考虑外，知网查重只能查两次还有可能与技术及成本有关。对于一个大型的学术资源平台来说，进行查重需要消耗大量的计算资源和存储空间，而且随着用户量的增加，系统的负担也会相应增加。因此，为了平衡资源投入和服务质量，知网可能设定了查重次数的限制。此外，限制查重次数也可以避免用户滥用服务，保持平台的正常运行秩序。综上所述，知网查重只能查两次的原因是多方面考量的结果，旨在维护平台的长期发展和用户体验。